Afin d'approfondir la réflexion sur des thématiques ou zones géographiques précises, l'opérateur peut constituer des groupes de travail spécifiques.
Ce sont les instances techniques de la réflexion.
Sous la conduite de l’opérateur local les membres des groupes de travail :
- analysent les inventaires biologiques et socio-économiques, en particulier les liens qui existent entre espèces/habitats présents et activités humaines locales,
- font des propositions d’objectifs et d’actions (dont contenu détaillé),
- Participent à la rédaction de la charte Natura 2000,
- participent au suivi de la mise en oeuvre du DOCOB.
Ces groupes de travail peuvent être mobilisés périodiquement lors de la phase de mise en œuvre du DOCOB, notamment pour les phases d'évaluation et d'actualisation du DOCOB.